MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 49551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018641	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995666
2	NC_018641	CGGT	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	409995666
3	NC_018641	ACAG	2	8	164	171	50 %	0 %	25 %	25 %	409995666
4	NC_018641	CTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409995666
5	NC_018641	CAGC	2	8	333	340	25 %	0 %	25 %	50 %	409995666
6	NC_018641	GAA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995666
7	NC_018641	GCT	2	6	474	479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995666
8	NC_018641	ACA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995666
9	NC_018641	TTTA	2	8	522	529	25 %	75 %	0 %	0 %	409995666
10	NC_018641	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995666
11	NC_018641	ATA	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995666
12	NC_018641	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995666
13	NC_018641	CAAAC	2	10	660	669	60 %	0 %	0 %	40 %	409995666
14	NC_018641	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995666
15	NC_018641	GAT	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995666
16	NC_018641	T	6	6	732	737	0 %	100 %	0 %	0 %	409995666
17	NC_018641	CA	3	6	752	757	50 %	0 %	0 %	50 %	409995666
18	NC_018641	GAA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995666
19	NC_018641	T	6	6	765	770	0 %	100 %	0 %	0 %	409995666
20	NC_018641	GCCT	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	409995666
21	NC_018641	GGTT	2	8	859	866	0 %	50 %	50 %	0 %	409995666
22	NC_018641	TAA	2	6	875	880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995666
23	NC_018641	TGTC	2	8	886	893	0 %	50 %	25 %	25 %	409995666
24	NC_018641	ACGT	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	409995666
25	NC_018641	TGA	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995666
26	NC_018641	GAAA	2	8	1207	1214	75 %	0 %	25 %	0 %	409995666
27	NC_018641	GC	3	6	1260	1265	0 %	0 %	50 %	50 %	409995666
28	NC_018641	CGG	2	6	1307	1312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995666
29	NC_018641	A	6	6	1345	1350	100 %	0 %	0 %	0 %	409995666
30	NC_018641	TGA	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995666
31	NC_018641	ATG	2	6	1644	1649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995667
32	NC_018641	AAC	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995667
33	NC_018641	CAACG	2	10	1771	1780	40 %	0 %	20 %	40 %	409995667
34	NC_018641	AAT	2	6	1787	1792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995667
35	NC_018641	TCA	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995667
36	NC_018641	CAT	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995667
37	NC_018641	A	6	6	2256	2261	100 %	0 %	0 %	0 %	409995667
38	NC_018641	CAA	2	6	2455	2460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995667
39	NC_018641	GAA	2	6	2537	2542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995667
40	NC_018641	CAA	2	6	2554	2559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995667
41	NC_018641	GCG	2	6	2565	2570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995667
42	NC_018641	AGA	2	6	2689	2694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995667
43	NC_018641	TCA	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995667
44	NC_018641	ATA	3	9	2861	2869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995668
45	NC_018641	ACGT	2	8	2961	2968	25 %	25 %	25 %	25 %	409995668
46	NC_018641	GAA	2	6	2976	2981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995668
47	NC_018641	TAG	3	9	3007	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995668
48	NC_018641	ACA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995669
49	NC_018641	T	6	6	3619	3624	0 %	100 %	0 %	0 %	409995669
50	NC_018641	GAG	2	6	3725	3730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409995669
51	NC_018641	GAT	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995669
52	NC_018641	GGCC	2	8	3772	3779	0 %	0 %	50 %	50 %	409995669
53	NC_018641	TGC	2	6	3843	3848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995670
54	NC_018641	ACA	2	6	3856	3861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995670
55	NC_018641	AATC	2	8	3923	3930	50 %	25 %	0 %	25 %	409995670
56	NC_018641	TCA	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995670
57	NC_018641	AAC	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995670
58	NC_018641	CT	3	6	4111	4116	0 %	50 %	0 %	50 %	409995670
59	NC_018641	GCG	2	6	4191	4196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995670
60	NC_018641	AGC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995670
61	NC_018641	AGC	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995670
62	NC_018641	ATC	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995670
63	NC_018641	TGAC	2	8	4343	4350	25 %	25 %	25 %	25 %	409995670
64	NC_018641	GC	4	8	4384	4391	0 %	0 %	50 %	50 %	409995670
65	NC_018641	GTT	2	6	4395	4400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995670
66	NC_018641	TGC	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995670
67	NC_018641	AGC	2	6	4550	4555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995670
68	NC_018641	GC	3	6	4558	4563	0 %	0 %	50 %	50 %	409995670
69	NC_018641	GAT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995670
70	NC_018641	GTT	2	6	4611	4616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995670
71	NC_018641	CAA	2	6	4660	4665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995670
72	NC_018641	CAC	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409995670
73	NC_018641	TGT	2	6	4754	4759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995670
74	NC_018641	ACC	2	6	4828	4833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409995670
75	NC_018641	ATC	2	6	4861	4866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995670
76	NC_018641	TGA	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995670
77	NC_018641	AAGA	2	8	5055	5062	75 %	0 %	25 %	0 %	409995671
78	NC_018641	GAAGA	2	10	5070	5079	60 %	0 %	40 %	0 %	409995671
79	NC_018641	GGC	2	6	5090	5095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
80	NC_018641	ATG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
81	NC_018641	CCAG	2	8	5107	5114	25 %	0 %	25 %	50 %	409995671
82	NC_018641	AGC	2	6	5178	5183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995671
83	NC_018641	CAT	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995671
84	NC_018641	TGA	2	6	5228	5233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
85	NC_018641	GCTG	2	8	5237	5244	0 %	25 %	50 %	25 %	409995671
86	NC_018641	TTGAAG	2	12	5260	5271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
87	NC_018641	ATA	2	6	5281	5286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995671
88	NC_018641	GGT	2	6	5385	5390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995671
89	NC_018641	CGG	4	12	5396	5407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
90	NC_018641	GTG	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995671
91	NC_018641	TAC	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995671
92	NC_018641	GGCAC	2	10	5556	5565	20 %	0 %	40 %	40 %	409995671
93	NC_018641	GAT	2	6	5637	5642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
94	NC_018641	ACC	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409995671
95	NC_018641	GC	3	6	5714	5719	0 %	0 %	50 %	50 %	409995671
96	NC_018641	GGC	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
97	NC_018641	A	6	6	5790	5795	100 %	0 %	0 %	0 %	409995671
98	NC_018641	GACAA	2	10	5830	5839	60 %	0 %	20 %	20 %	409995671
99	NC_018641	TTG	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995671
100	NC_018641	CAA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995671
101	NC_018641	GGC	2	6	5928	5933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
102	NC_018641	GAT	2	6	6015	6020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
103	NC_018641	GAT	2	6	6033	6038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
104	NC_018641	CGG	2	6	6055	6060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
105	NC_018641	GGT	2	6	6137	6142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995671
106	NC_018641	GGC	2	6	6245	6250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
107	NC_018641	CCTG	2	8	6302	6309	0 %	25 %	25 %	50 %	409995671
108	NC_018641	ACA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995671
109	NC_018641	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409995671
110	NC_018641	TCG	2	6	6361	6366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995671
111	NC_018641	TGG	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995671
112	NC_018641	GAA	2	6	6489	6494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995671
113	NC_018641	CCGATG	2	12	6583	6594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409995671
114	NC_018641	TTG	2	6	6618	6623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995671
115	NC_018641	GCC	2	6	6686	6691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409995671
116	NC_018641	AT	3	6	6725	6730	50 %	50 %	0 %	0 %	409995671
117	NC_018641	GAA	2	6	6741	6746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995671
118	NC_018641	GCC	2	6	6770	6775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409995671
119	NC_018641	GAC	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995671
120	NC_018641	TGTT	2	8	6976	6983	0 %	75 %	25 %	0 %	409995671
121	NC_018641	AAC	2	6	6990	6995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995671
122	NC_018641	GAT	2	6	7072	7077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995672
123	NC_018641	CGG	2	6	7207	7212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995672
124	NC_018641	ATGA	2	8	7225	7232	50 %	25 %	25 %	0 %	409995672
125	NC_018641	AAG	2	6	7261	7266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995672
126	NC_018641	TTG	2	6	7277	7282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995672
127	NC_018641	TGC	2	6	7472	7477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995672
128	NC_018641	CAA	2	6	7485	7490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995672
129	NC_018641	GATT	2	8	7497	7504	25 %	50 %	25 %	0 %	409995672
130	NC_018641	ATG	2	6	7517	7522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995672
131	NC_018641	GTT	2	6	7540	7545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995672
132	NC_018641	TTG	2	6	7567	7572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995672
133	NC_018641	CGGT	2	8	7595	7602	0 %	25 %	50 %	25 %	409995672
134	NC_018641	GAC	2	6	7605	7610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995672
135	NC_018641	CCG	2	6	7618	7623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409995672
136	NC_018641	CGG	2	6	7728	7733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995672
137	NC_018641	AT	3	6	7863	7868	50 %	50 %	0 %	0 %	409995672
138	NC_018641	GAAAA	2	10	7915	7924	80 %	0 %	20 %	0 %	409995672
139	NC_018641	TGG	2	6	8069	8074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995672
140	NC_018641	ATC	2	6	8135	8140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995672
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142	NC_018641	TGA	2	6	8238	8243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995672
143	NC_018641	ATC	2	6	8245	8250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995672
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146	NC_018641	ATC	2	6	8467	8472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995672
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148	NC_018641	TGAAGA	2	12	8553	8564	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409995672
149	NC_018641	AAG	2	6	8576	8581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995672
150	NC_018641	TCA	2	6	8588	8593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995672
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156	NC_018641	CTTG	2	8	8832	8839	0 %	50 %	25 %	25 %	409995672
157	NC_018641	ATG	2	6	8894	8899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995672
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159	NC_018641	GTT	2	6	8932	8937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995672
160	NC_018641	GCA	2	6	8972	8977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995672
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162	NC_018641	GACAA	2	10	9041	9050	60 %	0 %	20 %	20 %	409995672
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164	NC_018641	GAC	2	6	9454	9459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995672
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167	NC_018641	CTG	2	6	9557	9562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995672
168	NC_018641	GCA	2	6	9573	9578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995672
169	NC_018641	AAT	2	6	9686	9691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995672
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173	NC_018641	TTTC	2	8	9962	9969	0 %	75 %	0 %	25 %	409995673
174	NC_018641	TGA	2	6	10067	10072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995673
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249	NC_018641	TTTC	2	8	14239	14246	0 %	75 %	0 %	25 %	409995678
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262	NC_018641	GTT	2	6	15597	15602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995680
263	NC_018641	CTT	2	6	15707	15712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409995680
264	NC_018641	CAT	2	6	15725	15730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995680
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296	NC_018641	CCA	2	6	17227	17232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409995681
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